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La seconda parte del gioco è costituita da ''Kotoba no Puzzle: Xenopittan'', una raccolta di minigiochi linguistici -simili alle ''parole crociate''- basata sulla serie ''Kotoba no Puzzle: Mojipittan'' di '''Namco'''. La particolarità sta nel fatto che le parole usate non siano generiche ma contengano parecchi termini della [[Xenosaga]]. Essendo ''Mojipittan'' basato sull'utilizzo dei caratteri ''hiragana'' giapponesi (e di conseguenza pure ''Xenopittan'') non è mai stato pubblicato in Occidente, sorte toccata a questo stesso '''Xenosaga Freaks'''. È addirittura presente in questo minigioco una modalità per due giocatori split-screen, rendendo di fatto questo spin-off l'unico gioco di tutta la [[Xeno (serie)|serie Xeno]] ad integrare il multiplayer in locale.